L'histoire se situe dans une ère fictive, Seika. Une nouvelle loi entrée en vigueur au Japon, la loi d'amélioration des médias (メディア良化法, media ryoukahou), permet à une organisation armée de suspendre la vente de certains livres pour lesquels une enquête est jugée nécessaire. Cette opposition à la liberté d'expression est censée atteindre l'objectif "de protéger les droits de l'homme" et "d'éviter l'influence négative des médias sur les jeunes".
La jeune Iku Kasahara attendait avec impatience la suite d'un conte, dont le volume précédent datait d'il y a 10 ans. Quand elle se rend dans une librairie pour se procurer la suite, cette même librairie est soumise à une inspection par l'association gouvernementale chargée de maintenir cette loi. Ne voulant pas céder le livre qu'elle avait entre les mains, Iku était prête à aller devant la police pour être accusée de vol.
A ce moment arriva alors un membre du corps des bibliothécaires de Kantou. Cette association, également créée par le gouvernement, est soutenue par la loi de la liberté des bibliothèques, et possède une armée formée pour contrer le contrôle de l'association adverse sur les médias.
L'homme mystérieux annonce alors à Iku qu'elle peut garder ce livre, comme elle était prête à le protéger.
Enormément touchée par l'apparition de cet allié de la justice, Iku va alors intégrer la base de la bibliothèque de Kantou, afin de protéger les livres, tout comme son héros l'a fait pour elle auparavant. Evidemment, il lui arrivera de pousser son sens de la justice un peu trop loin, ou de ne pas spécialement s'entendre avec d'autres personnes de la base, comme son tuteur Doujou Atsushi ...